紫金山天文台瞄准国家战略需求和世界科技前沿，不断拓宽研究和服务领域，持续引进和培养杰出人才，加强国际合作与交流，承担国家、中国科学院和省部级天文基础研究与航天空间应用重大科研项目，在国内外核心刊物发表了一系列具有重要影响的论文，获得了国家和省部级众多自然科学和科技进步奖，完成了众多国家任务，为我国天文事业的发展、国家经济和国家安全以及社会文明进步作出了重大贡献。　　 

2008年，紫金山天文台争取和承担的主要科研任务和在研项目90项。在研国家自然科学基金39项，其中创新群体1项，重点项目3项，杰出青年5项。2008年批准12项（2009年执行），其中重点项目3项。在研中科院“百人计划”3项，创新方向性项目5项，院国际合作项目1项。 

2008年，紫金山天文台获得江苏省科技奖二等奖1项，推荐国家自然科学奖1项。申请发明专利4项，软件著作权登记2项，授权发明专利2项。发表论文150篇，其中SCI上发表论文117篇，Nature论文2篇。